MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 1026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	GTT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019754	AAAT	2	8	42	49	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019754	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
4	NC_019754	CAA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308169
5	NC_019754	CAGT	2	8	171	178	25 %	25 %	25 %	25 %	428308169
6	NC_019754	AC	4	8	193	200	50 %	0 %	0 %	50 %	428308169
7	NC_019754	AAG	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
8	NC_019754	A	6	6	249	254	100 %	0 %	0 %	0 %	428308169
9	NC_019754	CAAA	2	8	515	522	75 %	0 %	0 %	25 %	428308170
10	NC_019754	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
11	NC_019754	AATA	2	8	667	674	75 %	25 %	0 %	0 %	428308170
12	NC_019754	CACATT	2	12	709	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
13	NC_019754	AGA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
14	NC_019754	GT	3	6	753	758	0 %	50 %	50 %	0 %	428308170
15	NC_019754	AAG	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
16	NC_019754	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	428308170
17	NC_019754	AACACC	2	12	825	836	50 %	0 %	0 %	50 %	428308170
18	NC_019754	AGC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
19	NC_019754	ACT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
20	NC_019754	CAA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
21	NC_019754	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308170
22	NC_019754	CACT	2	8	1080	1087	25 %	25 %	0 %	50 %	428308170
23	NC_019754	GTC	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
24	NC_019754	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
25	NC_019754	TAC	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
26	NC_019754	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
27	NC_019754	TAG	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
28	NC_019754	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
29	NC_019754	ATG	3	9	1367	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
30	NC_019754	AAATT	2	10	1378	1387	60 %	40 %	0 %	0 %	428308170
31	NC_019754	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
32	NC_019754	AGC	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
33	NC_019754	CGT	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
34	NC_019754	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
35	NC_019754	AAT	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
36	NC_019754	AAT	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
37	NC_019754	TTTG	2	8	1614	1621	0 %	75 %	25 %	0 %	428308170
38	NC_019754	ATG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
39	NC_019754	GAT	3	9	1837	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
40	NC_019754	AAT	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
41	NC_019754	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
42	NC_019754	CTG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
43	NC_019754	ATG	3	9	1976	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
44	NC_019754	AATG	2	8	2062	2069	50 %	25 %	25 %	0 %	428308170
45	NC_019754	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
46	NC_019754	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
47	NC_019754	TGT	2	6	2307	2312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308170
48	NC_019754	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
49	NC_019754	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
50	NC_019754	GGCT	2	8	2403	2410	0 %	25 %	50 %	25 %	428308170
51	NC_019754	ACA	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
52	NC_019754	CAC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308170
53	NC_019754	TTG	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019754	TTA	2	6	2766	2771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019754	TGCAC	2	10	2811	2820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019754	GCAC	2	8	2830	2837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019754	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019754	A	6	6	2919	2924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019754	TTTG	2	8	2976	2983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019754	TTG	2	6	3114	3119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019754	TTG	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019754	TAA	2	6	3238	3243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019754	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
64	NC_019754	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
65	NC_019754	A	6	6	3423	3428	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
66	NC_019754	TA	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
67	NC_019754	AACT	2	8	3475	3482	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
68	NC_019754	TCT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
69	NC_019754	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
70	NC_019754	CA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	0 %	50 %	428308171
71	NC_019754	TGT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
72	NC_019754	GTAA	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	428308171
73	NC_019754	AAG	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
74	NC_019754	T	6	6	3708	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
75	NC_019754	GTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
76	NC_019754	T	6	6	3779	3784	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
77	NC_019754	GCTACA	2	12	3831	3842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308171
78	NC_019754	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
79	NC_019754	GTT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
80	NC_019754	AGC	3	9	3983	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
81	NC_019754	CATA	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
82	NC_019754	TC	3	6	4077	4082	0 %	50 %	0 %	50 %	428308171
83	NC_019754	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
84	NC_019754	GTC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
85	NC_019754	TAAA	3	12	4150	4161	75 %	25 %	0 %	0 %	428308171
86	NC_019754	TAAATA	2	12	4211	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
87	NC_019754	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
88	NC_019754	TCA	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
89	NC_019754	TTA	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
90	NC_019754	T	6	6	4361	4366	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
91	NC_019754	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
92	NC_019754	GATG	2	8	4446	4453	25 %	25 %	50 %	0 %	428308171
93	NC_019754	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
94	NC_019754	TCT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
95	NC_019754	AGA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
96	NC_019754	A	6	6	4579	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
97	NC_019754	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
98	NC_019754	ATT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
99	NC_019754	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
100	NC_019754	AT	3	6	4701	4706	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
101	NC_019754	TA	4	8	4821	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019754	ACT	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019754	GTT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019754	CAC	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019754	TAT	2	6	4958	4963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019754	TTG	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019754	TCC	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_019754	TAC	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019754	TTA	3	9	5050	5058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019754	TTA	2	6	5136	5141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019754	ATT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019754	AACC	2	8	5264	5271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019754	TGT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019754	TAAT	2	8	5385	5392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019754	ACA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019754	GC	3	6	5455	5460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019754	CTA	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019754	CA	3	6	5551	5556	50 %	0 %	0 %	50 %	428308172
119	NC_019754	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308172
120	NC_019754	ACTGC	2	10	5595	5604	20 %	20 %	20 %	40 %	428308172
121	NC_019754	ATCA	2	8	5656	5663	50 %	25 %	0 %	25 %	428308172
122	NC_019754	CAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019754	TTG	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019754	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019754	TAA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019754	ATATT	2	10	6031	6040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019754	ATA	2	6	6044	6049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019754	T	6	6	6062	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019754	A	6	6	6074	6079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019754	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308173
131	NC_019754	TAT	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308173
132	NC_019754	AGAT	2	8	6262	6269	50 %	25 %	25 %	0 %	428308173
133	NC_019754	CAGAAA	2	12	6276	6287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308173
134	NC_019754	ATC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308173
135	NC_019754	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308173
136	NC_019754	A	7	7	6368	6374	100 %	0 %	0 %	0 %	428308173
137	NC_019754	GTA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308173
138	NC_019754	GTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019754	TGG	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019754	GAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019754	GAA	2	6	6619	6624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019754	GGT	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_019754	TGA	2	6	6702	6707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_019754	TAT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_019754	TGG	2	6	12701	12706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_019754	TAA	2	6	12801	12806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019754	T	6	6	12842	12847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019754	AAATT	2	10	12897	12906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019754	TAC	2	6	12928	12933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_019754	CTC	2	6	13003	13008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_019754	TA	4	8	13043	13050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019754	AT	3	6	13053	13058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019754	ACC	2	6	13077	13082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_019754	TA	3	6	13083	13088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019754	TA	3	6	13102	13107	50 %	50 %	0 %	0 %	428308181
270	NC_019754	A	6	6	13128	13133	100 %	0 %	0 %	0 %	428308181
271	NC_019754	ACA	2	6	13200	13205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308181
272	NC_019754	GTTGC	2	10	13309	13318	0 %	40 %	40 %	20 %	428308181
273	NC_019754	AAC	2	6	13330	13335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308181
274	NC_019754	AT	3	6	13346	13351	50 %	50 %	0 %	0 %	428308181
275	NC_019754	CTAA	2	8	13362	13369	50 %	25 %	0 %	25 %	428308181
276	NC_019754	AACTAA	2	12	13394	13405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308181
277	NC_019754	ATT	2	6	13448	13453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308181
278	NC_019754	ATGT	2	8	13524	13531	25 %	50 %	25 %	0 %	428308181
279	NC_019754	GAT	2	6	13536	13541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308181
280	NC_019754	GCT	2	6	13562	13567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308181
281	NC_019754	GTTT	2	8	13598	13605	0 %	75 %	25 %	0 %	428308181
282	NC_019754	CTGATG	2	12	13609	13620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428308181
283	NC_019754	TAA	2	6	13643	13648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308181
284	NC_019754	TAT	2	6	13651	13656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308181
285	NC_019754	TAA	2	6	13676	13681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308181
286	NC_019754	ATA	2	6	13714	13719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019754	CTAA	2	8	13733	13740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
288	NC_019754	A	7	7	13801	13807	100 %	0 %	0 %	0 %	428308182
289	NC_019754	CAT	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308182
290	NC_019754	AGA	2	6	13933	13938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308182
291	NC_019754	A	6	6	13999	14004	100 %	0 %	0 %	0 %	428308182
292	NC_019754	GTT	2	6	14032	14037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308182
293	NC_019754	CTGTT	2	10	14261	14270	0 %	60 %	20 %	20 %	428308183
294	NC_019754	AAT	2	6	14309	14314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308183
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297	NC_019754	TCA	2	6	14406	14411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308183
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299	NC_019754	TTTA	2	8	14489	14496	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
300	NC_019754	TGT	2	6	14517	14522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308183
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306	NC_019754	TTC	2	6	14748	14753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
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309	NC_019754	AAAT	2	8	14837	14844	75 %	25 %	0 %	0 %	428308183
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313	NC_019754	TA	3	6	14981	14986	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
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317	NC_019754	ATA	2	6	15132	15137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308183
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319	NC_019754	TA	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
320	NC_019754	CTT	2	6	15255	15260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
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322	NC_019754	TATT	2	8	15385	15392	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
323	NC_019754	CTT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
324	NC_019754	ATT	2	6	15417	15422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_019754	TAA	2	6	15429	15434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_019754	CTATCT	2	12	15481	15492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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328	NC_019754	TATCGC	2	12	15602	15613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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330	NC_019754	CTG	2	6	15676	15681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
331	NC_019754	AGAA	2	8	15708	15715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
332	NC_019754	CTAGAA	2	12	15834	15845	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
333	NC_019754	AGTG	2	8	15860	15867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
334	NC_019754	ACTGAA	2	12	15882	15893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
335	NC_019754	ATT	2	6	15925	15930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_019754	TTTA	2	8	15976	15983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_019754	ACT	2	6	16059	16064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_019754	AGT	2	6	16068	16073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
339	NC_019754	T	6	6	16122	16127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
340	NC_019754	GCA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308184
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360	NC_019754	CCTG	2	8	17242	17249	0 %	25 %	25 %	50 %	428308184
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393	NC_019754	T	6	6	18933	18938	0 %	100 %	0 %	0 %	428308184
394	NC_019754	AGT	2	6	18952	18957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308184
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397	NC_019754	AAG	2	6	19039	19044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308184
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399	NC_019754	GCA	2	6	19079	19084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308184
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401	NC_019754	AGAC	2	8	19352	19359	50 %	0 %	25 %	25 %	428308184
402	NC_019754	AAG	2	6	19381	19386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308184
403	NC_019754	ACTC	2	8	19571	19578	25 %	25 %	0 %	50 %	428308185
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500	NC_019754	A	6	6	24414	24419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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